Skip to main content

Table 1 Summary statistics for the logistic model of presence/absence of 84 relatively abundant species in Paracou

From: The relative importance of dispersal limitation and habitat preference in shaping spatial distribution of saplings in a tropical moist forest: a case study along a combination of hydromorphic and canopy disturbance gradients

Taxon

Abund.

R 2

Intercept

OddDhS

OddAlt

OddSLD

OddUhS

OddDist

OddClump

PSoil

PDist

PEnv

PClump

χ2Soil

χ2Dist

χ2Clump

PTorus

Anaxagorea dolichocarpa Sprague & Sandwith

470

0.24

9.56

NA

NA

NA

NA

1.10

0.13

NA

0.002

0.002

0.000

NA

9.83

128.24

0.000

Apeiba glabra Aubl.

73

0.12

0.39

NA

NA

NA

NA

0.73

0.51

NA

0.001

0.001

0.000

NA

10.57

16.97

0.001

Bocoa prouacensis Aubl.

60

0.02

0.13

NA

NA

NA

NA

NA

0.60

NA

NA

NA

0.001

NA

NA

10.11

NA

Capparis frondosa Jacq.

56

0.13

0.64

0.49

0.24

0.41

0.29

NA

0.41

0.048

NA

0.048

0.000

9.61

NA

28.47

0.037

Carapa procera DC.

44

0.01

0.03

NA

NA

NA

NA

0.85

NA

NA

0.050

0.050

NA

NA

3.84

NA

0.122

Catostemma fragrans Benth.

108

0.02

0.03

NA

NA

NA

NA

1.20

NA

NA

0.000

0.000

NA

NA

13.91

NA

0.001

Cecropia obtusa Trécul

73

0.20

0.47

NA

NA

NA

NA

0.47

0.54

NA

0.000

0.000

0.001

NA

23.96

11.24

0.000

Conceveiba guianensis Aubl.

80

0.06

0.11

0.81

1.04

0.44

0.29

0.75

NA

0.032

0.000

0.000

NA

10.53

18.80

NA

0.027

Cordia nodosa Lam.

51

0.00

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

Cordia sagotii I.M.Johnst.

53

0.15

0.44

NA

NA

NA

NA

0.72

0.49

NA

0.003

0.003

0.000

NA

9.06

21.53

0.034

Couratari oblongifolia Ducke & R.Knuth

63

0.11

0.07

3.19

5.09

5.04

4.64

NA

0.49

0.100

NA

0.100

0.000

7.79

NA

22.18

0.126

Cupania rubiginosa (Poir.) Radlk.

63

0.11

0.45

NA

NA

NA

NA

NA

0.40

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

34.93

NA

Dicorynia guianensis Amshoff

55

0.19

0.27

1.00

0.00

2.65

2.94

NA

0.39

0.051

NA

0.051

0.000

9.45

NA

32.10

0.032

Drypetes variabilis Uittien

47

0.07

0.27

NA

NA

NA

NA

NA

0.45

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

23.56

NA

Duguetia calycina Benoist

114

0.07

0.44

NA

NA

NA

NA

NA

0.45

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

32.76

NA

Duguetia yeshidan Sandwith

122

0.61

5.50

NA

NA

NA

NA

1.71

0.11

NA

0.001

0.001

0.000

NA

10.38

37.42

0.002

Eperua falcata Aubl.

238

0.30

8.01

NA

NA

NA

NA

1.08

0.13

NA

0.063

0.063

0.000

NA

3.47

101.17

0.014

Eperua grandiflora (Aubl.) Benth.

46

0.22

0.63

NA

NA

NA

NA

NA

0.37

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

36.96

NA

Eschweilera congestiflora (Benoist) Eyma

44

0.15

0.05

3.16

6.55

4.83

8.28

1.13

0.43

0.065

0.141

0.065

0.000

8.84

2.17

24.81

0.003

Eschweilera coriacea (DC.) S.A.Mori

58

0.13

0.47

NA

NA

NA

NA

NA

0.40

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

39.80

NA

Eschweilera decolorans Sandwith

43

0.28

1.39

NA

NA

NA

NA

NA

0.27

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

44.04

NA

Eschweilera sagotiana Miers

206

0.04

0.60

NA

NA

NA

NA

NA

0.46

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

31.04

NA

Goupia glabra Aubl.

99

0.22

0.40

1.05

2.27

0.59

0.72

0.46

0.65

0.054

0.000

0.000

0.028

9.30

35.50

4.81

0.000

Guarea costata A.Juss.

54

0.24

0.15

3.05

7.14

2.08

1.33

NA

0.42

0.003

NA

0.003

0.000

15.73

NA

27.54

0.015

Guatteria punctata (Aubl.) R.A.Howard

43

0.14

0.45

NA

NA

NA

NA

0.83

0.44

NA

0.069

0.069

0.000

NA

3.32

24.60

0.096

Gustavia hexapetala (Aubl.) Sm.

64

0.01

0.09

NA

NA

NA

NA

NA

0.70

NA

NA

NA

0.021

NA

NA

5.29

NA

Hebepetalum humiriifolium (Planch.) Benth.

72

0.25

2.60

NA

NA

NA

NA

NA

0.20

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

60.18

NA

Henriettella flavescens (Aubl.) Triana

198

0.20

3.24

0.74

0.18

0.60

0.22

0.88

0.29

0.007

0.009

0.007

0.000

14.07

6.89

70.50

0.242

Inga cayennensis Sagot ex Benth.

41

0.09

0.02

1.16

0.20

0.35

0.00

0.73

1.42

0.105

0.001

0.001

0.062

7.65

11.53

3.49

0.008

Inga loubryana Poncy

87

0.11

0.26

1.52

3.87

1.63

2.33

NA

0.42

0.013

NA

0.013

0.000

12.66

NA

31.72

0.008

Inga pezizifera Benth.

106

0.33

1.39

1.50

1.75

0.22

0.98

0.78

0.34

0.177

0.044

0.044

0.000

6.32

4.04

36.93

0.409

Inga stipularis DC.

136

0.11

0.62

NA

NA

NA

NA

0.77

0.49

NA

0.000

0.000

0.000

NA

14.14

21.08

0.001

Inga umbellifera (Vahl) Steud.

45

0.07

0.13

NA

NA

NA

NA

0.70

0.71

NA

0.001

0.001

0.028

NA

11.23

4.81

0.024

Iryanthera hostmannii (Benth.) Warb.

54

0.04

0.16

NA

NA

NA

NA

NA

0.55

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

14.08

NA

Iryanthera sagotiana (Benth.) Warb.

183

0.18

0.95

1.42

4.25

2.14

2.10

NA

0.27

0.000

NA

0.000

0.000

22.63

NA

63.63

0.030

Jacaranda copaia (Aubl.)D.Don

116

0.13

0.45

1.08

2.72

0.73

0.72

0.80

0.51

0.002

0.002

0.002

0.000

16.60

9.78

19.27

0.019

Laetia procera (Poepp.) Eichler

52

0.51

1.08

4.48

6.25

1.06

0.08

0.27

0.30

0.109

0.000

0.000

0.000

7.55

16.09

19.78

0.001

Lecythis persistens Sagot subsp. persistens

390

0.08

2.27

0.78

0.26

0.69

0.57

0.94

0.37

0.003

0.045

0.003

0.000

16.41

4.02

45.04

0.232

Licania alba (Bernoulli) Cuatrec.

211

0.09

0.99

NA

NA

NA

NA

1.06

0.34

NA

0.107

0.107

0.000

NA

2.60

56.51

0.275

Licania canescens Benoist

93

0.13

0.92

NA

NA

NA

NA

NA

0.32

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

52.54

NA

Licania heteromorpha Benth. var heteromorpha

135

0.06

0.10

3.08

4.51

3.10

3.44

NA

0.56

0.008

NA

0.008

0.000

13.93

NA

17.54

0.001

Licania membranacea Sagot ex Laness.

206

0.03

0.18

0.99

1.59

1.68

1.51

1.09

0.62

0.052

0.023

0.023

0.001

9.37

5.15

11.07

0.032

Licania sprucei (Hook.f.) Fritsch

52

0.00

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

Loreya arborescens (Aubl.) DC.

62

0.38

6.54

NA

NA

NA

NA

0.65

0.16

NA

0.018

0.018

0.000

NA

5.60

37.56

0.000

Loreya mespiloides Miq.

259

0.24

1.84

NA

NA

NA

NA

0.55

0.40

NA

0.000

0.000

0.000

NA

48.18

22.97

0.000

Mabea piriri Aubl.

57

0.35

3.89

0.57

0.28

0.82

0.24

0.84

0.26

0.144

0.068

0.068

0.000

6.85

3.32

46.23

0.397

Miconia acuminata (Steud.) Naudin

324

0.41

17.31

NA

NA

NA

NA

0.60

0.15

NA

0.000

0.000

0.000

NA

35.53

85.07

0.000

Miconia minutiflora (Bonpl.) DC.

46

0.36

1.40

NA

NA

NA

NA

0.41

0.37

NA

0.000

0.000

0.000

NA

13.56

22.73

0.002

Miconia tschudyoides Cogn.

523

0.39

17.65

1.07

0.83

1.98

1.04

0.72

0.13

0.004

0.000

0.000

0.000

15.51

30.32

109.28

0.014

Oxandra asbeckii (Pulle) R.E.Fr.

459

0.17

5.40

NA

NA

NA

NA

1.05

0.19

NA

0.124

0.124

0.000

NA

2.37

122.74

0.002

Paypayrola guianensis Aubl.

66

0.33

2.76

NA

NA

NA

NA

1.19

0.15

NA

0.042

0.042

0.000

NA

4.15

59.53

0.024

Pogonophora schomburgkiana Miers ex Benth.

176

0.14

0.97

NA

NA

NA

NA

1.08

0.32

NA

0.063

0.063

0.000

NA

3.46

60.37

0.047

Poraqueiba guianensis Aubl.

67

0.02

0.02

2.22

1.47

2.64

3.38

NA

NA

0.083

NA

0.083

NA

8.25

NA

NA

0.324

Pouteria bangii (Rusby) T.D.Penn.

41

0.00

0.09

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

NA

Pradosia cochlearia (Lecomte) T.D.Penn.

92

0.09

0.10

3.05

3.21

2.89

3.16

1.13

0.45

0.158

0.031

0.031

0.000

6.62

4.66

25.99

0.039

Protium giganteum Engl. var. crassifolium (Engl.) Daly

47

0.07

0.26

NA

NA

NA

NA

NA

0.46

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

22.15

NA

Protium opacum Swart subsp. rabelianum Daly

174

0.11

0.86

0.59

1.04

0.32

0.66

0.83

0.52

0.007

0.000

0.000

0.000

14.26

13.34

18.17

0.027

Qualea rosea Aubl.

128

0.37

0.66

1.18

9.71

1.19

1.58

NA

0.32

0.000

NA

0.000

0.000

59.21

NA

42.80

0.053

Recordoxylon speciosum (Benoist) Gazel ex Barneby

46

0.06

0.16

NA

NA

NA

NA

NA

0.56

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

17.94

NA

Rinorea amapensis Hekking

63

0.44

10.93

NA

NA

NA

NA

NA

0.12

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

51.67

NA

Sandwithia guyanensis Lanj.

209

0.59

5.45

2.27

7.72

2.01

2.27

1.32

0.09

0.023

0.000

0.000

0.000

11.38

12.98

50.13

0.029

Schefflera decaphylla (Sagot ex Seem.) Harms

59

0.11

0.21

1.03

1.87

1.25

2.81

0.87

0.50

0.062

0.084

0.062

0.000

8.96

2.98

15.85

0.034

Simaba cedron Planch.

83

0.02

0.16

NA

NA

NA

NA

NA

0.60

NA

NA

NA

0.001

NA

NA

11.41

NA

Sterculia pruriens (Aubl.) K.Schum.

134

0.11

0.35

1.19

2.60

0.75

0.82

0.77

0.62

0.003

0.000

0.000

0.002

15.98

17.18

9.73

0.094

Swartzia leblondii R.S.Cowan

65

0.01

0.08

NA

NA

NA

NA

NA

0.72

NA

NA

NA

0.038

NA

NA

4.29

NA

Symphonia sp. 1

79

0.10

0.03

6.56

4.99

10.80

7.46

NA

0.56

0.015

NA

0.015

0.000

12.35

NA

12.29

0.005

Tachigali melinonii (Harms) Zarucchi & Herend.

56

0.20

0.62

1.75

1.03

0.44

0.36

0.82

0.40

0.038

0.139

0.038

0.000

10.16

2.19

29.86

0.291

Talisia guianensis Aubl.

124

0.04

0.25

NA

NA

NA

NA

1.08

0.52

NA

0.100

0.100

0.000

NA

2.71

21.37

0.143

Talisia hexaphylla Vahl

66

0.03

0.13

NA

NA

NA

NA

NA

0.62

NA

NA

NA

0.001

NA

NA

11.45

NA

Talisia megaphylla Sagot ex Radlk.

48

0.01

0.02

NA

NA

NA

NA

1.13

NA

NA

0.083

0.083

NA

NA

3.01

NA

0.147

Tapirira guianensis Aubl.

119

0.20

1.59

NA

NA

NA

NA

0.76

0.32

NA

0.003

0.003

0.000

NA

8.60

42.91

0.001

Tapirira obtusa (Benth.) J.D.Mitch.

75

0.25

1.19

0.76

1.53

0.27

0.35

0.78

0.38

0.058

0.020

0.020

0.000

9.13

5.41

28.96

0.452

Theobroma subincanum Mart.

45

0.06

0.23

NA

NA

NA

NA

NA

0.47

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

21.71

NA

Tovomita brasiliensis (Mart.) Walp.

54

0.10

0.08

2.24

1.54

3.72

1.79

NA

0.55

0.081

NA

0.081

0.000

8.31

NA

18.77

0.191

Tovomita brevistaminea Engl.

108

0.01

0.14

NA

NA

NA

NA

NA

0.69

NA

NA

NA

0.007

NA

NA

7.34

NA

Tovomita sp. 2

62

0.02

0.13

NA

NA

NA

NA

NA

0.60

NA

NA

NA

0.001

NA

NA

10.35

NA

Trichilia schomburgkii C.DC.

87

0.19

0.53

NA

NA

NA

NA

1.19

0.33

NA

0.002

0.002

0.000

NA

9.56

56.46

0.004

Unonopsis rufescens (Baill.) R.E.Fr.

53

0.02

0.11

NA

NA

NA

NA

NA

0.63

NA

NA

NA

0.006

NA

NA

7.67

NA

Unonopsis stipitata Diels

93

0.04

0.10

1.50

2.69

1.74

2.64

NA

0.62

0.065

NA

0.065

0.001

8.83

NA

11.49

0.249

Virola michelii Heckel

93

0.17

0.13

1.93

8.55

1.40

2.24

0.87

0.57

0.000

0.068

0.000

0.001

37.33

3.33

11.70

0.001

Vismia guianensis (Aubl.) Choisy

55

0.40

1.39

2.69

0.01

3.14

0.86

0.32

0.32

0.121

0.000

0.000

0.000

7.29

16.64

27.56

0.025

Vismia sessilifolia (Aubl.) Choisy

162

0.38

7.40

NA

NA

NA

NA

0.40

0.19

NA

0.000

0.000

0.000

NA

33.80

46.17

0.000

Votomita guianensis Aubl.

199

0.12

0.90

NA

NA

NA

NA

NA

0.40

NA

NA

NA

0.000

NA

NA

50.49

NA

Xylopia nitida Dunal

255

0.35

5.73

1.34

2.83

0.95

1.63

0.61

0.20

0.005

0.000

0.000

0.000

14.70

29.59

64.87

0.000

  1. R2 = Nagelkerke index. Odds ratio, P values and χ2 statistics are given for the following factors or factor levels a/soil type: down-hill system (DhS), alloterite <1.2 m (Alt), superficial lateral drainage (SLD), up-hill system (UhS), superficial hydromorphy (SH) is taken to be the reference b/distance to logging damage (logscale) c/distance to conspecific (Clump, logscale). Env is the minimum of soil (drainage) and disturbance (Dist). Last column (P Torus), reports the frequency of lower residual deviances found when model is applied after random torus translation of environmental factors map with regard to stem map